記者12日從華中農業(yè)大學獲悉,，該校張建偉教授課題組聯合國內外高校與科研團隊,，以代表亞洲稻群體結構的高質量基因組為對象,，構建并全面分析基因組倒位圖譜,，建成了世界上首個基于同源基因簇的水稻泛基因組綜合數據庫——水稻基因索引數據庫。相關研究成果發(fā)表在《自然·通訊》與《分子植物》,。

亞洲栽培稻是世界一半人口的主食,。預計2060年至2070年，世界人口數量將增加到約100億,，科研人員迫切需要培育產量高,、營養(yǎng)豐富,、綠色環(huán)保和氣候適應性更強的新品種。

張建偉介紹,，全球有約500萬份水稻種質及其野生近緣種，這些資源的基因組變異中（單核苷酸多態(tài)性,、插入缺失,、倒位和易位等）蘊藏著品種改良的重要信息，對其開展基于泛基因組的多組學研究具有重要意義,。

水稻基因索引數據庫可為每個水稻基因建立一張“綜合圖文信息卡片”,，實現不同功能和常用數據庫之間的快速鏈接，記錄包括OGI,、基因通用名,、序列、功能,、表達等基本信息,，并以可交互示意圖展示該基因轉錄本結構、可變剪接事件,、同源關系網絡圖和系統(tǒng)發(fā)育樹等,。

該平臺能為用戶提供豐富的模塊和工具，方便研究人員對不同種質基因以及基因同源關系進行查詢,、分析和可視化,，為全球水稻研究學者提供免費在線檢索和分析服務。研究人員可以通過關鍵詞,、序列,、同源關系等3種方式在數據庫中進行搜索，并在微觀和宏觀尺度對種質間基因組共線性進行分析和可視化研究,。

（原標題：我國建成世界首個水稻基因索引數據庫）

【責任編輯：肖　好】

【內容審核：林思冰】